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分子克隆流程及注意事项 - ag尊龙凯时酶切连接指南

来源:施馨阳 日期:2025-03-23

一、酶切连接的重要性

ag尊龙凯时在生物医疗领域中,酶切连接的过程中选择合适的限制性内切酶至关重要。选择时应考虑以下几个方面:

分子克隆流程及注意事项 - ag尊龙凯时酶切连接指南

1. 限制性内切酶的选择标准

在目的载体中应只存在一个识别序列,而在目的片段中应当不存在。尽量选择生成粘性末端且酶切效率高的限制性内切酶,例如BamHI、HindIII等。

2. 酶切时的注意事项

在进行双酶切时,需要特别注意缓冲液对两种限制性内切酶活性的影响,并根据其活性调整酶的用量和反应时间。如果缓冲液不能同时满足两种酶的活性要求,则应考虑分步酶切。在进行单酶切时,建议对线性化的载体进行去磷酸化,以减少载体自身环化的可能性。

3. 去磷酸化的重要性

在酶切后,为了防止载体自连,尤其是在酶切后产物末端可互补或是平端的情况下,有必要进行载体的去磷酸化。碱性磷酸酶能够有效去除载体末端的5’磷酸基团,降低自连的风险。

二、引物设计与PCR扩增

ag尊龙凯时在进行目的片段的PCR扩增时,引物设计是关键步骤。根据载体线性化所用的限制性内切酶,分别在上下游引物的5’端引入对应的酶切位点及保护碱基。建议使用高保真酶进行PCR扩增,并优化退火温度以提高反应效率。

三、PCR/酶切产品的纯化

在完成PCR或酶切反应后,需要对产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,以确认是否存在目的大小的条带。推荐使用切胶回收法进行纯化,切胶时间最好控制在3分钟内,以减少紫外线对DNA的损伤。在回收过程中,利用NanoDrop或OneDrop等仪器检测回收浓度,并确保仅存在目的条带。

四、目的片段与载体的连接

为了实现酶切后载体与目的片段的连接重组,建议使用T4 DNA连接酶。连接体系中线性化载体与目的片段的摩尔比可调节在1:1至1:10之间,最佳比例一般为1:3。在连接平末端载体与DNA片段时,需首先进行去磷酸化操作,以减少载体自身环化的可能性。

五、感受态细胞的转化

在将连接产物转化入感受态细胞时,建议选择克隆用化学感受态细胞,而非表达用细胞。适合≤15kb质粒转化的细胞包括DH5α和Fast-T1,适合10kb质粒的则是XL10。推荐的转化比为1:10,例如10μl重组产物添加至100μl感受态细胞。

六、单克隆菌落的PCR鉴定

挑选适中大小的单克隆菌落进行鉴定,避免过大或过小的菌落。将挑取的菌落放入含10μl ddH2O的EP管中,充分混匀后吸取1-2μl作为PCR反应的模板。推荐使用位于片段和载体上下游的一对引物进行PCR鉴定,以确保实验的准确性和高效性。

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